Doanh nghiệp đang bị thanh tra thuế có được xác nhận hoàn thành nghĩa vụ thuế không?

I. CĂN CỨ PHÁP LÝ

1. Luật Quản lý thuế số 38/2019/QH14, được Quốc hội thông qua ngày 13/6/2019;
2. Luật Doanh nghiệp số 59/2020/QH14, được Quốc hội thông qua ngày 17/6/2020;
3. Nghị định số 126/2020/NĐ-CP, do Chính phủ ban hành ngày 19/10/2020;
4. Nghị định số 125/2020/NĐ-CP, do Chính phủ ban hành ngày 19/10/2020;
5. Các văn bản hướng dẫn thi hành khác có liên quan còn hiệu lực.

II. ĐANG BỊ THANH TRA THUẾ CÓ ĐƯỢC XÁC NHẬN HOÀN THÀNH NGHĨA VỤ THUẾ KHÔNG?

Câu trả lời trọng tâm: Thông thường, trong thời gian đang thanh tra thuế, cơ quan thuế sẽ không xác nhận hoàn thành nghĩa vụ thuế cho doanh nghiệp.

Lý do:

1. Thanh tra thuế có thể phát sinh nghĩa vụ bổ sung.
2. Kết luận thanh tra chưa được ban hành.
3. Nghĩa vụ thuế có thể thay đổi sau khi có quyết định xử lý.

Vì vậy, việc xác nhận hoàn thành nghĩa vụ thuế chỉ có thể thực hiện sau khi:

1. Có kết luận thanh tra chính thức.
2. Doanh nghiệp đã thực hiện đầy đủ nghĩa vụ theo kết luận đó.
3. Không còn khoản nợ thuế hoặc tiền chậm nộp.

👉 Xem thêm: Thủ tục đối chiếu, xác nhận nghĩa vụ thuế với cơ quan thuế mới nhất

III. PHÂN BIỆT THANH TRA THUẾ VÀ KIỂM TRA THUẾ

Việc hiểu đúng bản chất giúp doanh nghiệp xác định khả năng xin xác nhận nghĩa vụ thuế.

1. Kiểm tra thuế

1. Thường tập trung vào hồ sơ khai thuế.
2. Phạm vi hẹp hơn.
3. Thời gian xử lý ngắn hơn thanh tra.

2. Thanh tra thuế

1. Phạm vi rộng, có thể nhiều kỳ tính thuế.
2. Kiểm tra toàn diện hoạt động tài chính.
3. Có khả năng phát sinh truy thu lớn.

Ảnh 1: Doanh nghiệp đang bị thanh tra thuế có được xác nhận hoàn thành nghĩa vụ thuế không – Luật TLK 097.211.8764/ 0969.760.195       

Trong thời gian thanh tra thuế, cơ quan thuế cần giữ quyền xác định nghĩa vụ phát sinh. Do đó, việc xác nhận hoàn thành nghĩa vụ thuế trong giai đoạn này gần như không khả thi.

IV. KHI NÀO CƠ QUAN THUẾ TỪ CHỐI XÁC NHẬN HOÀN THÀNH NGHĨA VỤ THUẾ?

Cơ quan thuế có thể từ chối xác nhận nếu:

1. Doanh nghiệp đang trong quá trình thanh tra hoặc kiểm tra chưa kết thúc.
2. Có khoản thuế đang bị khiếu nại chưa giải quyết xong.
3. Có dấu hiệu sai phạm cần xác minh bổ sung.

👉 Xem thêm: Chưa xác nhận hoàn thành nghĩa vụ thuế có được chuyển nhượng doanh nghiệp không? Phân tích mới nhất

V. QUY TRÌNH XỬ LÝ SAU KHI CÓ KẾT LUẬN THANH TRA THUẾ

Sau khi kết thúc thanh tra, cơ quan thuế sẽ ban hành:

1. Kết luận thanh tra.
2. Quyết định xử lý về thuế (nếu có sai phạm).
3. Thông báo số tiền thuế truy thu, tiền chậm nộp và tiền phạt.

Trong giai đoạn này, doanh nghiệp chưa thể được xác nhận hoàn thành nghĩa vụ thuế nếu chưa thực hiện đầy đủ nghĩa vụ theo quyết định xử lý.

Trình tự an toàn pháp lý gồm:

1. Rà soát kết luận thanh tra

1. Kiểm tra căn cứ pháp lý áp dụng.
2. Đối chiếu số liệu truy thu.
3. Xác định có cần khiếu nại hay không.

2. Thực hiện nghĩa vụ theo quyết định

1. Nộp đủ số thuế truy thu.
2. Nộp tiền chậm nộp.
3. Nộp tiền xử phạt (nếu có).

Chỉ khi hoàn thành các nghĩa vụ này, doanh nghiệp mới có cơ sở đề nghị xác nhận hoàn thành nghĩa vụ thuế.

👉 Xem thêm: Bị treo mã số thuế có được xác nhận hoàn thành nghĩa vụ thuế không?

VI. TRƯỜNG HỢP DOANH NGHIỆP KHIẾU NẠI KẾT LUẬN THANH TRA

Trong thực tế, nhiều doanh nghiệp lựa chọn khiếu nại vì cho rằng:

1. Việc áp dụng chính sách thuế chưa chính xác.
2. Cách tính tiền chậm nộp có sai sót.
3. Có sự khác biệt trong cách hiểu quy định pháp luật.

Tuy nhiên, trong thời gian khiếu nại:

1. Nghĩa vụ thuế chưa được xác định là đã hoàn thành.
2. Cơ quan thuế thường chưa xác nhận hoàn thành nghĩa vụ thuế.
3. Rủi ro kéo dài thời gian xử lý phát sinh.

Ảnh 2: Xử lý nghĩa vụ thuế sau thanh tra để được xác nhận hoàn thành – Luật TLK 097.211.8764/ 0969.760.195  

Do đó, nếu doanh nghiệp có kế hoạch giải thể, chuyển nhượng hoặc tham gia giao dịch lớn, cần cân nhắc chiến lược xử lý thanh tra thuế một cách chủ động.

VII. RỦI RO NẾU CỐ TÌNH XIN XÁC NHẬN KHI CHƯA HOÀN TẤT THANH TRA

Một số doanh nghiệp nộp hồ sơ xin xác nhận hoàn thành nghĩa vụ thuế trong khi:

1. Thanh tra chưa kết thúc.
2. Nghĩa vụ chưa được xác định dứt điểm.

Hệ quả có thể gồm:

1. Hồ sơ bị từ chối.
2. Bị đánh giá thiếu thiện chí hợp tác.
3. Làm kéo dài tiến độ giải thể hoặc chuyển nhượng.

👉 Xem thêm: Doanh nghiệp chưa xác nhận hoàn thành nghĩa vụ thuế có được giải thể không?

VIII. CHECKLIST CHUẨN BỊ XIN XÁC NHẬN SAU THANH TRA

Để tăng khả năng được xác nhận hoàn thành nghĩa vụ thuế, TLK khuyến nghị:

1. Hoàn tất toàn bộ nghĩa vụ theo kết luận thanh tra.
2. Lưu trữ đầy đủ chứng từ nộp tiền.
3. Đối chiếu lại tình trạng nợ thuế trên hệ thống.
4. Chuẩn bị văn bản đề nghị xác nhận theo đúng mẫu.
5. Theo dõi phản hồi và bổ sung hồ sơ kịp thời.

Việc chủ động xử lý sau thanh tra giúp doanh nghiệp rút ngắn thời gian được xác nhận hoàn thành nghĩa vụ thuế và hạn chế rủi ro pháp lý kéo dài.

IX. MỨC XỬ PHẠT VÀ HỆ QUẢ PHÁP LÝ SAU THANH TRA THUẾ

Khi kết luận thanh tra xác định doanh nghiệp có sai phạm, các nghĩa vụ tài chính có thể bao gồm:

1. Truy thu thuế

1. Thuế giá trị gia tăng kê khai thiếu.
2. Thuế thu nhập doanh nghiệp tính sai chi phí.
3. Các loại thuế khác phát sinh trong kỳ thanh tra.

Khoản truy thu phải được nộp đầy đủ trước khi doanh nghiệp có thể đề nghị xác nhận hoàn thành nghĩa vụ thuế.

2. Tiền chậm nộp

1. Tính trên số tiền thuế chậm nộp.
2. Tính từ ngày hết hạn nộp thuế đến ngày thực nộp.
3. Không phụ thuộc vào việc doanh nghiệp đang thanh tra hay đã thay đổi người đại diện.

3. Xử phạt vi phạm hành chính về thuế

Tùy mức độ vi phạm có thể bị:

1. Phạt do khai sai dẫn đến thiếu số thuế phải nộp.
2. Phạt do trốn thuế nếu đủ yếu tố cấu thành.
3. Phạt do sử dụng hóa đơn sai quy định.

👉 Xem thêm: Trách nhiệm người đại diện theo pháp luật khi chưa hoàn thành nghĩa vụ thuế
Xem thêm: Doanh nghiệp bị phong tỏa tài khoản ngân hàng do nợ thuế – quy định và cách xử lý hợp pháp

Trong giai đoạn này, doanh nghiệp chắc chắn chưa được xác nhận hoàn thành nghĩa vụ thuế cho đến khi xử lý dứt điểm toàn bộ nghĩa vụ tài chính.

X. CHIẾN LƯỢC XỬ LÝ THANH TRA ĐỂ SỚM ĐƯỢC XÁC NHẬN NGHĨA VỤ THUẾ

Để rút ngắn thời gian được xác nhận hoàn thành nghĩa vụ thuế, TLK khuyến nghị chiến lược 3 bước:

1. Chủ động chuẩn bị hồ sơ trước thanh tra

1. Rà soát sổ sách kế toán.
2. Đối chiếu dữ liệu thuế đã kê khai.
3. Xử lý sai sót trước khi đoàn thanh tra làm việc.

2. Phản hồi chuyên nghiệp trong quá trình thanh tra

1. Cung cấp tài liệu đúng thời hạn.
2. Giải trình bằng căn cứ pháp lý rõ ràng.
3. Lập biên bản làm việc chặt chẽ.

3. Hoàn tất nghĩa vụ ngay sau kết luận

1. Nộp đủ truy thu và tiền phạt.
2. Theo dõi cập nhật tình trạng nợ thuế.
3. Nộp hồ sơ đề nghị xác nhận hoàn thành nghĩa vụ thuế.

👉 Xem thêm: Cưỡng chế thuế có được xác nhận hoàn thành nghĩa vụ thuế không? Giải đáp mới nhất

Ảnh 3: Quy trình xử lý thanh tra thuế để được xác nhận hoàn thành nghĩa vụ thuế – Luật TLK 097.211.8764/ 0969.760.195  

XI. CÁC CÂU HỎI THƯỜNG GẶP CỦA KHÁCH HÀNG

1. Trong thời gian thanh tra có được xác nhận hoàn thành nghĩa vụ thuế không?

Thông thường không, vì nghĩa vụ thuế chưa được xác định dứt điểm.

2. Nếu thanh tra không phát hiện sai phạm thì sao?

Sau khi có kết luận không truy thu và không còn nợ thuế, doanh nghiệp có thể đề nghị xác nhận.

3. Có bắt buộc phải nộp đủ tiền truy thu trước khi xin xác nhận không?

Có. Nghĩa vụ tài chính phải được hoàn thành đầy đủ.

4. Trong thời gian khiếu nại kết luận thanh tra có được xác nhận không?

Thông thường chưa được xác nhận vì nghĩa vụ chưa xử lý dứt điểm.

5. Thanh tra thuế có ảnh hưởng đến thủ tục giải thể không?

Có. Doanh nghiệp phải hoàn tất nghĩa vụ thuế trước khi giải thể.

6. Có thể vừa thanh tra vừa chuyển nhượng doanh nghiệp không?

Về thủ tục đăng ký kinh doanh có thể thực hiện, nhưng rủi ro thuế rất lớn.

7. Nếu đã nộp tiền nhưng hệ thống chưa cập nhật thì sao?

Cần cung cấp chứng từ nộp tiền và đề nghị cơ quan thuế cập nhật.

8. Thời gian xác nhận hoàn thành nghĩa vụ thuế sau thanh tra là bao lâu?

Tùy từng cơ quan thuế và tình trạng hồ sơ.

9. Doanh nghiệp có nên thuê đơn vị chuyên sâu xử lý thanh tra không?

Nên, đặc biệt trong trường hợp truy thu lớn hoặc giao dịch M&A đang diễn ra.

10. TLK có hỗ trợ xử lý thanh tra và xin xác nhận nghĩa vụ thuế không?

Có. TLK cung cấp dịch vụ rà soát, làm việc với cơ quan thuế và hỗ trợ hoàn tất thủ tục xác nhận hoàn thành nghĩa vụ thuế.

👉 Quý Khách hàng có thể tham khảo thêm thông tin về Hệ sinh thái TLK và các gói ưu đãi dịch vụ Pháp lý, Kế toán – Thuế đang được áp dụng dưới đây.

🔗 Chính sách ưu đãi dịch vụ pháp lý của Công ty Luật TLK

🔗 Chính sách ưu đãi dịch vụ Kế toán – Thuế của Công ty Tư vấn và Đại lý thuế TLK Global

🔗 Hệ sinh thái TLK: Công ty Luật TLK và Công ty Tư vấn và Đại lý Thuế TLK Global

XII. THÔNG TIN LIÊN HỆ CÔNG TY LUẬT TLK

Trong các tình huống thanh tra thuế phức tạp, việc kiểm soát rủi ro và hoàn tất nghĩa vụ đúng thời điểm quyết định khả năng được xác nhận hoàn thành nghĩa vụ thuế.

Chúng tôi không chỉ cung cấp dịch vụ đơn lẻ – mà chúng tôi còn kiến tạo hệ thống bảo vệ doanh nghiệp một cách thực chất và bền vững.

CÔNG TY LUẬT TLK

🌐 Website: https://tlklawfirm.vn
📧 Email: info@tlklawfirm.vn
☎ Tel: 0243.2011.747
📞 Hotline: 097.211.8764 / 0969.760.195