Doanh nghiệp mới thành lập phải nộp những loại thuế nào?

I. CĂN CỨ PHÁP LÝ

1. Luật Thuế thu nhập doanh nghiệp số 67/2025/QH15 do Quốc hội ban hành ngày 14/06/2025;

2. Luật Thuế giá trị gia tăng số 48/2024/QH15 do Quốc hội ban hành ngày 26/11/2024;

3. Luật Thuế thu nhập cá nhân số 109/2025/QH15 do Quốc hội ban hành ngày 10/12/2025, có hiệu lực thi hành từ ngày 01/07/2026;

4. Luật Quản lý thuế số 38/2019/QH14 do Quốc hội ban hành ngày 13/06/2019;

5. Nghị định số 126/2020/NĐ-CP do Chính phủ ban hành ngày 19/10/2020, quy định chi tiết một số điều của Luật Quản lý thuế;

6. Các văn bản hướng dẫn thi hành khác có liên quan còn hiệu lực tại thời điểm áp dụng.

II. NHẬN ĐỊNH PHÁP LÝ VÀ CHIẾN LƯỢC KIỂM SOÁT RỦI RO

Thực tiễn cho thấy, phần lớn doanh nghiệp mới tập trung vào thủ tục thành lập mà chưa chuẩn bị đầy đủ kế hoạch thuế ban đầu. Hệ quả là nhiều nghĩa vụ kê khai bị bỏ sót, dẫn đến xử phạt hành chính chỉ sau vài tháng hoạt động.

Bài viết này phân tích những loại thuế doanh nghiệp mới thành lập phải nộp trong năm đầu hoạt động, giúp doanh nghiệp chủ động tuân thủ và tránh rủi ro ngay từ đầu, dựa trên kinh nghiệm thực tiễn của Công ty Luật TLK.

III. CÁC LOẠI THUẾ DOANH NGHIỆP BẮT BUỘC PHẢI KÊ KHAI NGAY TỪ KHI THÀNH LẬP

Ngay sau khi được cấp Giấy chứng nhận đăng ký doanh nghiệp, doanh nghiệp đã chính thức phát sinh tư cách pháp lý và kéo theo nghĩa vụ thuế tương ứng, dù chưa phát sinh doanh thu.

1. Lệ phí môn bài

Lệ phí môn bài là khoản nghĩa vụ đầu tiên doanh nghiệp phải quan tâm trong năm đầu:

• Doanh nghiệp phải kê khai và nộp lệ phí môn bài theo bậc vốn điều lệ;

• Một số trường hợp được miễn lệ phí môn bài trong năm đầu thành lập theo chính sách hiện hành.

Sai sót thường gặp là không kê khai đúng thời hạn, hoặc hiểu sai trường hợp được miễn, dẫn đến bị xử phạt chậm nộp.

2. Nghĩa vụ đăng ký phương pháp kê khai thuế

Doanh nghiệp mới thành lập phải:

• Đăng ký phương pháp kê khai thuế giá trị gia tăng;

• Xác định kỳ kê khai theo tháng hoặc theo quý;

• Thực hiện các thủ tục thuế ban đầu theo yêu cầu của cơ quan thuế quản lý.

Việc lựa chọn sai phương pháp kê khai có thể ảnh hưởng trực tiếp đến dòng tiền và khả năng khấu trừ thuế trong giai đoạn đầu hoạt động.

👉 Xem thêm: Doanh nghiệp phải nộp những loại thuế nào trong suốt vòng đời hoạt động?

IV. THUẾ PHÁT SINH TRONG NĂM ĐẦU KHI DOANH NGHIỆP BẮT ĐẦU HOẠT ĐỘNG

Sau giai đoạn hoàn tất thủ tục ban đầu, khi doanh nghiệp bắt đầu có giao dịch, nghĩa vụ thuế sẽ phát sinh theo thực tế hoạt động.

1. Thuế giá trị gia tăng

Thuế giá trị gia tăng phát sinh khi:

• Doanh nghiệp xuất hóa đơn bán hàng, cung ứng dịch vụ;

• Doanh nghiệp có hóa đơn đầu vào cần khấu trừ.

Rủi ro phổ biến trong năm đầu là kê khai sai kỳ, sử dụng hóa đơn không hợp lệ, hoặc chưa nắm rõ quy trình quản lý hóa đơn điện tử.

2. Thuế thu nhập doanh nghiệp tạm tính

Ngay trong năm đầu, doanh nghiệp vẫn phải:

• Xác định kết quả kinh doanh tạm tính;

• Thực hiện nghĩa vụ liên quan đến thuế thu nhập doanh nghiệp khi có thu nhập chịu thuế.

Nhiều doanh nghiệp lầm tưởng rằng chỉ quyết toán cuối năm mới phát sinh nghĩa vụ, dẫn đến thiếu chủ động trong quản trị thuế.

👉 Xem thêm: Doanh nghiệp mới thành lập phải nộp những loại thuế nào?

Ảnh 1: Doanh nghiệp mới thành lập phải nộp những loại thuế nào – Hotline 097.211.8764/ 0969.760.195

V. HỒ SƠ BỊ TỪ CHỐI VÀ CÁCH CÔNG TY LUẬT TLK XỬ LÝ

Trong năm đầu hoạt động, nhiều doanh nghiệp chưa phát sinh doanh thu nhưng vẫn bị xử phạt do hồ sơ thuế không hợp lệ hoặc thực hiện sai trình tự. Đây là nhóm rủi ro rất phổ biến với doanh nghiệp mới thành lập.

1. Các dạng hồ sơ thường bị từ chối trong năm đầu

Từ thực tiễn hỗ trợ doanh nghiệp mới, Công ty Luật TLK nhận thấy các hồ sơ sau thường bị cơ quan thuế yêu cầu giải trình hoặc từ chối:

• Hồ sơ kê khai lệ phí môn bài nộp sai thời hạn;

• Hồ sơ đăng ký phương pháp kê khai thuế giá trị gia tăng không đúng mẫu;

• Tờ khai thuế giá trị gia tăng nộp thiếu kỳ hoặc nộp nhầm phương pháp;

• Hồ sơ sử dụng hóa đơn điện tử chưa đúng quy định;

• Hồ sơ kê khai thuế nhưng không phản ánh đúng tình trạng hoạt động thực tế.

Nguyên nhân chính không nằm ở việc “không nộp thuế”, mà nằm ở thiếu hiểu biết về nghĩa vụ kê khai ngay từ khi thành lập.

2. Cách Công ty Luật TLK xử lý hồ sơ bị từ chối

Với các trường hợp hồ sơ bị từ chối hoặc có nguy cơ bị xử phạt, Công ty Luật TLK không xử lý đơn lẻ từng tờ khai, mà thực hiện:

• Rà soát toàn bộ nghĩa vụ thuế phát sinh từ thời điểm thành lập;

• Đánh giá nguyên nhân sai sót (thủ tục, thời hạn, phương pháp kê khai);

• Hoàn thiện lại hồ sơ theo đúng trình tự pháp luật;

• Hỗ trợ giải trình với cơ quan thuế trong phạm vi cho phép.

Cách tiếp cận này giúp doanh nghiệp khắc phục sai sót từ gốc, tránh bị lặp lỗi trong các kỳ tiếp theo.

👉 Xem thêm: Doanh nghiệp chưa có doanh thu có phải kê khai và nộp thuế không?

VI. LỖI THƯỜNG GẶP – RỦI RO – MỨC PHẠT TRONG NĂM ĐẦU HOẠT ĐỘNG

Năm đầu hoạt động được xem là giai đoạn rủi ro cao nhất về thuế đối với doanh nghiệp mới. Phần lớn vi phạm không xuất phát từ hành vi trốn thuế, mà từ sai sót thủ tục và nhận thức chưa đầy đủ.

1. Lỗi thường gặp của doanh nghiệp mới thành lập

Một số lỗi phổ biến gồm:

• Không kê khai thuế do nhầm lẫn “chưa có doanh thu thì không phải kê khai”;

• Không nộp lệ phí môn bài đúng thời hạn;

• Kê khai sai kỳ thuế hoặc sai phương pháp thuế giá trị gia tăng;

• Không quản lý chặt chẽ hóa đơn điện tử ngay từ đầu;

• Không cập nhật thay đổi chính sách thuế áp dụng cho doanh nghiệp mới.

Những lỗi này nếu kéo dài sẽ dẫn đến vi phạm chồng vi phạm.

2. Rủi ro pháp lý và mức phạt có thể phát sinh

Tùy mức độ vi phạm, doanh nghiệp có thể đối mặt với:

• Phạt vi phạm hành chính do chậm nộp tờ khai;

• Phạt do kê khai sai dẫn đến thiếu số thuế phải nộp;

• Tiền chậm nộp tính theo số ngày vi phạm;

• Nguy cơ bị đưa vào diện rủi ro cao để thanh tra sớm.

Đáng lưu ý, nhiều doanh nghiệp bị xử phạt ngay trong năm đầu, gây ảnh hưởng tiêu cực đến dòng tiền và tâm lý khởi sự.

👉 Xem thêm: Các loại thuế doanh nghiệp phải nộp trong quá trình hoạt động

VII. LỢI ÍCH KHI DOANH NGHIỆP MỚI THÀNH LẬP SỬ DỤNG DỊCH VỤ CỦA CÔNG TY LUẬT TLK

Thay vì tự xử lý từng nghĩa vụ thuế rời rạc, việc sử dụng dịch vụ pháp lý – thuế ngay từ đầu giúp doanh nghiệp:

• Xác định chính xác nghĩa vụ thuế trong từng giai đoạn;

• Tránh sai sót thủ tục dẫn đến xử phạt không đáng có;

• Tiết kiệm thời gian và chi phí xử lý hậu quả;

• Tạo nền tảng hồ sơ thuế sạch cho các năm tiếp theo.

Đây là lợi thế đặc biệt quan trọng với doanh nghiệp mới, khi nguồn lực còn hạn chế nhưng rủi ro pháp lý lại cao.

Ảnh 2: Hồ sơ thuế doanh nghiệp mới thành lập bị từ chối – Công ty Luật TLK – Hotline 097.211.8764/ 0969.760.195

VIII. LỢI ÍCH KHI DOANH NGHIỆP QUẢN TRỊ NGHĨA VỤ THUẾ ĐÚNG NGAY TỪ ĐẦU

Trong thực tiễn tư vấn và xử lý các hồ sơ thuế cho doanh nghiệp, Công ty Luật TLK nhận thấy rằng phần lớn rủi ro về thuế không phát sinh do cố tình vi phạm, mà xuất phát từ việc không nhận diện đầy đủ nghĩa vụ thuế ngay từ đầu hoặc áp dụng sai chính sách thuế theo từng giai đoạn hoạt động. Việc quản trị nghĩa vụ thuế bài bản mang lại cho doanh nghiệp nhiều lợi ích cốt lõi, cả về pháp lý lẫn tài chính.

1. Giảm thiểu rủi ro truy thu, xử phạt và thanh tra kéo dài

Khi doanh nghiệp xác định đúng các loại thuế phải nộp trong suốt vòng đời hoạt động và thực hiện kê khai, nộp thuế đúng quy định, nguy cơ bị truy thu thuế, phạt chậm nộp hoặc xử phạt hành chính được giảm thiểu đáng kể. Điều này đặc biệt quan trọng trong bối cảnh cơ quan thuế ngày càng tăng cường thanh tra, kiểm tra theo phương thức quản lý rủi ro.

2. Tối ưu chi phí thuế trên cơ sở hợp pháp

Quản trị thuế đúng không đồng nghĩa với việc nộp thuế nhiều hơn, mà là nộp đúng – đủ – đúng thời điểm. Doanh nghiệp có thể tận dụng hợp pháp các chính sách ưu đãi, khấu trừ, miễn giảm thuế theo Luật Thuế thu nhập doanh nghiệp số 67/2025/QH15 và Luật Thuế giá trị gia tăng số 48/2024/QH15, từ đó tối ưu dòng tiền và hiệu quả kinh doanh.

3. Chủ động kế hoạch tài chính và chiến lược phát triển

Khi nghĩa vụ thuế được dự báo và kiểm soát, doanh nghiệp có thể chủ động xây dựng kế hoạch tài chính, kế hoạch đầu tư, mở rộng sản xuất kinh doanh mà không bị động trước các khoản truy thu hoặc nghĩa vụ thuế phát sinh bất ngờ.

4. Nâng cao uy tín pháp lý của doanh nghiệp

Doanh nghiệp tuân thủ tốt nghĩa vụ thuế thường được đánh giá cao khi làm việc với ngân hàng, đối tác, nhà đầu tư hoặc trong các thương vụ mua bán, sáp nhập. Hồ sơ thuế “sạch” là một trong những yếu tố then chốt thể hiện tính minh bạch và quản trị tốt của doanh nghiệp.

5. Giảm áp lực pháp lý cho ban lãnh đạo và bộ phận kế toán

Khi có định hướng và tư vấn thuế đúng ngay từ đầu, ban lãnh đạo doanh nghiệp và bộ phận kế toán có thể tập trung vào hoạt động kinh doanh cốt lõi, thay vì phải xử lý các rủi ro pháp lý phát sinh do sai sót về thuế.

IX. QUY TRÌNH CÔNG TY LUẬT TLK HỖ TRỢ DOANH NGHIỆP THỰC HIỆN NGHĨA VỤ THUẾ

Từ thực tiễn nhiều năm trực tiếp đồng hành cùng doanh nghiệp trong suốt vòng đời hoạt động – từ giai đoạn thành lập, vận hành, tái cấu trúc đến giải thể – Công ty Luật TLK xây dựng quy trình hỗ trợ nghĩa vụ thuế theo hướng chủ động – phòng ngừa – kiểm soát rủi ro.

1. Rà soát tổng thể nghĩa vụ thuế theo từng giai đoạn hoạt động

Doanh nghiệp được rà soát toàn diện các sắc thuế phát sinh tương ứng với từng giai đoạn: thành lập, vận hành ổn định, mở rộng, tạm ngừng hoặc chấm dứt hoạt động. Việc rà soát này giúp doanh nghiệp không bỏ sót nghĩa vụ, đồng thời tránh kê khai thừa, kê khai sai.

2. Tư vấn áp dụng đúng chính sách thuế theo pháp luật hiện hành

Công ty Luật TLK tư vấn áp dụng đúng Luật Thuế thu nhập doanh nghiệp số 67/2025/QH15, Luật Thuế giá trị gia tăng số 48/2024/QH15 và Luật Thuế thu nhập cá nhân số 109/2025/QH15 (hiệu lực từ 01/07/2026), bảo đảm an toàn pháp lý tuyệt đối khi thực hiện nghĩa vụ thuế.

3. Đại diện làm việc với cơ quan thuế khi cần thiết

Trong trường hợp doanh nghiệp bị thanh tra, kiểm tra hoặc phát sinh vướng mắc, Công ty Luật TLK đại diện doanh nghiệp làm việc trực tiếp với cơ quan thuế, giúp giảm áp lực, kiểm soát rủi ro truy thu – xử phạt.

X. CAM KẾT CỦA CÔNG TY LUẬT TLK VỀ THUẾ DOANH NGHIỆP

Công ty Luật TLK cam kết cung cấp dịch vụ tư vấn và hỗ trợ thuế doanh nghiệp trên nền tảng pháp lý chuẩn xác – thực tiễn – an toàn dài hạn:

• Cam kết đúng pháp luật: Chỉ áp dụng văn bản pháp luật còn hiệu lực hoặc đã ban hành và có mốc hiệu lực rõ ràng; tuyệt đối không sử dụng luật đã hết hiệu lực.

• Cam kết tối ưu chi phí thuế hợp pháp: Giúp doanh nghiệp tận dụng đầy đủ các ưu đãi, khấu trừ, miễn giảm theo quy định.

• Cam kết bảo mật thông tin: Hồ sơ, số liệu tài chính – thuế của doanh nghiệp được bảo mật tuyệt đối.

• Cam kết đồng hành dài hạn: Không chỉ xử lý từng vụ việc đơn lẻ mà xây dựng chiến lược thuế bền vững cho doanh nghiệp.

XI. CÁC CÂU HỎI THƯỜNG GẶP CỦA KHÁCH HÀNG

1. Doanh nghiệp mới thành lập có phải nộp thuế ngay không?
Doanh nghiệp phải kê khai thuế ngay từ khi phát sinh hoạt động, kể cả trường hợp chưa có doanh thu.

2. Doanh nghiệp không phát sinh doanh thu có phải nộp thuế không?
Không phải nộp thuế thu nhập doanh nghiệp, nhưng vẫn phải thực hiện kê khai theo quy định.

3. Khi nào doanh nghiệp phải quyết toán thuế thu nhập doanh nghiệp?
Cuối năm tài chính hoặc khi chấm dứt hoạt động, chuyển đổi loại hình doanh nghiệp.

4. Doanh nghiệp có bắt buộc phải kê khai thuế giá trị gia tăng không?
Có, trừ trường hợp thuộc đối tượng không chịu thuế hoặc áp dụng phương pháp trực tiếp.

5. Thuế thu nhập cá nhân của người lao động do ai nộp?
Doanh nghiệp có trách nhiệm khấu trừ, kê khai và nộp thay cho người lao động.

6. Doanh nghiệp có thể bị xử phạt nếu kê khai sai thuế không?
Có, mức phạt phụ thuộc vào tính chất, mức độ vi phạm và số thuế liên quan.

7. Khi nào doanh nghiệp nên thuê đơn vị tư vấn thuế?
Nên thuê ngay từ khi thành lập hoặc khi phát sinh hoạt động phức tạp về thuế.

8. Doanh nghiệp có được hoàn thuế giá trị gia tăng không?
Có, nếu đáp ứng đầy đủ điều kiện theo quy định của pháp luật thuế hiện hành.

9. Khi bị thanh tra thuế, doanh nghiệp cần chuẩn bị gì?
Hồ sơ kế toán, chứng từ thuế, giải trình chính sách áp dụng và người đại diện làm việc.

10. Công ty Luật TLK có hỗ trợ tư vấn thuế thường xuyên không?
Có, Công ty Luật TLK cung cấp dịch vụ tư vấn thuế định kỳ và trọn gói cho doanh nghiệp.

👉 Quý Khách hàng có thể tham khảo thêm thông tin về Hệ sinh thái TLK và các gói ưu đãi dịch vụ Pháp lý, Kế toán – Thuế đang được áp dụng dưới đây.

🔗 Chính sách ưu đãi dịch vụ pháp lý của Công ty Luật TLK

🔗 Chính sách ưu đãi dịch vụ Kế toán – Thuế của Công ty Tư vấn và Đại lý thuế TLK Global

🔗 Hệ sinh thái TLK: Công ty Luật TLK và Công ty Tư vấn và Đại lý Thuế TLK Global

XII. THÔNG TIN LIÊN HỆ CÔNG TY LUẬT TLK

Thực hiện nghĩa vụ thuế đúng và đủ không chỉ là yêu cầu pháp lý, mà còn là yếu tố then chốt bảo đảm sự phát triển bền vững của doanh nghiệp. Nếu doanh nghiệp đang cần tư vấn nghĩa vụ thuế, rà soát rủi ro, hoặc xây dựng chiến lược thuế an toàn dài hạn, Công ty Luật TLK sẵn sàng đồng hành và hỗ trợ chuyên sâu.

CÔNG TY LUẬT TLK

🌐 Website: tlklawfirm.vn

📧 Email: info@tlklawfirm.vn

☎ Tel: 0243.2011.747

📞Hotline: 097.211.8764 / 0969.760.195