Thanh tra thuế đang diễn ra có được xác nhận nghĩa vụ thuế không? Giải đáp mới nhất

I. CĂN CỨ PHÁP LÝ

1. Luật Quản lý thuế số 38/2019/QH14 được Quốc hội thông qua ngày 13/6/2019;
2. Luật Doanh nghiệp số 59/2020/QH14 được Quốc hội thông qua ngày 17/6/2020;
3. Nghị định số 126/2020/NĐ-CP do Chính phủ ban hành ngày 19/10/2020;
4. Thông tư số 80/2021/TT-BTC do Bộ Tài chính ban hành ngày 29/9/2021;
5. Các văn bản hướng dẫn thi hành khác có liên quan còn hiệu lực.

II. NHẬN ĐỊNH PHÁP LÝ VÀ CHIẾN LƯỢC KIỂM SOÁT RỦI RO

Trong đa số trường hợp thực tiễn, khi doanh nghiệp đang bị thanh tra thuế hoặc kiểm tra thuế toàn diện, cơ quan thuế sẽ tạm thời chưa xác nhận hoàn thành nghĩa vụ thuế cho đến khi kết thúc thanh tra và ban hành kết luận chính thức.

Bởi lẽ, trong thời gian thanh tra:

• Nghĩa vụ thuế có thể bị điều chỉnh.
• Có thể phát sinh truy thu.
• Có thể bị xử phạt và tính tiền chậm nộp bổ sung.

Do đó, tại thời điểm thanh tra chưa kết thúc, nghĩa vụ thuế chưa được “chốt” cuối cùng về mặt pháp lý.

👉 Xem thêm: Thủ tục đối chiếu, xác nhận nghĩa vụ thuế với cơ quan thuế mới nhất

III. VÌ SAO THANH TRA THUẾ LÀM TẠM DỪNG XÁC NHẬN NGHĨA VỤ?

1. Nghĩa vụ thuế chưa được xác định cuối cùng

Thanh tra thuế là hoạt động kiểm tra toàn diện nhằm xác định lại tính chính xác của:

• Doanh thu
• Chi phí
• Thuế phải nộp
• Các khoản miễn giảm

Khi chưa có kết luận chính thức, không thể khẳng định doanh nghiệp đã hoàn thành đầy đủ nghĩa vụ.

2. Nguyên tắc quản lý rủi ro của cơ quan thuế

Cơ quan thuế phải bảo đảm:

• Không xác nhận sai tình trạng nghĩa vụ.
• Không tạo khoảng trống pháp lý để doanh nghiệp hoàn tất thủ tục khác khi nghĩa vụ chưa được xác định đầy đủ.

👉 Xem thêm: Xác nhận không nợ thuế khi giải thể doanh nghiệp – Quy trình mới nhất

IV. PHÂN BIỆT THANH TRA THUẾ VÀ KIỂM TRA THUẾ

Tiêu chí	Thanh tra thuế	Kiểm tra thuế
Phạm vi	Toàn diện	Theo chuyên đề
Thời gian	Dài	Ngắn hơn
Khả năng truy thu	Cao	Trung bình
Ảnh hưởng đến xác nhận	Thường tạm dừng	Phụ thuộc mức độ

Ảnh 1: Thanh tra thuế và kiểm tra thuế ảnh hưởng thế nào đến xác nhận nghĩa vụ thuế – Luật TLK 097.211.8764/ 0969.760.195       

V. RỦI RO PHÁP LÝ KHI DOANH NGHIỆP CẦN GẤP XÁC NHẬN TRONG THỜI GIAN THANH TRA

Trong thực tiễn, nhiều doanh nghiệp cần xác nhận nghĩa vụ thuế gấp để:

• Giải thể doanh nghiệp
• Chuyển nhượng vốn
• Tham gia đấu thầu
• Vay vốn ngân hàng
• Thực hiện tái cấu trúc

Tuy nhiên, nếu đang trong quá trình thanh tra mà vẫn cố gắng xin xác nhận, có thể phát sinh các rủi ro sau:

1. Hồ sơ bị từ chối ngay từ đầu

Cơ quan thuế thường tra cứu tình trạng thanh tra trên hệ thống. Nếu đang có quyết định thanh tra chưa kết thúc, hồ sơ sẽ bị trả lại.

2. Kéo dài thời gian thanh tra

Việc nộp hồ sơ không đúng thời điểm có thể:

• Phát sinh yêu cầu giải trình bổ sung
• Tăng mức độ rà soát hồ sơ
• Làm chậm tiến độ kết luận

3. Ảnh hưởng đến thủ tục giải thể hoặc chuyển nhượng

Nếu doanh nghiệp đang làm thủ tục giải thể mà chưa có xác nhận nghĩa vụ thuế:

• Hồ sơ giải thể sẽ bị đình lại
• Không thể hoàn tất nghĩa vụ với cơ quan đăng ký kinh doanh

👉 Xem thêm: Đối chiếu nghĩa vụ thuế trước khi chuyển nhượng vốn – Hướng dẫn mới nhất

4. Rủi ro trách nhiệm cá nhân người đại diện

Trong một số trường hợp, nếu doanh nghiệp cố tình thực hiện giao dịch khi nghĩa vụ thuế chưa được xác định đầy đủ, người đại diện theo pháp luật có thể bị xem xét trách nhiệm liên đới.

VI. TRƯỜNG HỢP NGOẠI LỆ CÓ THỂ ĐƯỢC XÁC NHẬN

Không phải mọi trường hợp thanh tra đều bị từ chối xác nhận tuyệt đối.

1. Thanh tra chuyên đề nhỏ

Nếu thanh tra chỉ tập trung vào một khoản mục cụ thể và không ảnh hưởng tổng thể nghĩa vụ thuế, cơ quan thuế có thể xem xét xác nhận với điều kiện:

• Doanh nghiệp cam kết thực hiện nghĩa vụ bổ sung nếu phát sinh
• Không có dấu hiệu trốn thuế hoặc gian lận

2. Kiểm tra hồ sơ tại cơ quan thuế

Trường hợp chỉ kiểm tra hồ sơ khai thuế tại trụ sở cơ quan thuế và chưa ban hành quyết định thanh tra chính thức, việc xác nhận có thể vẫn được thực hiện tùy từng địa phương.

👉 Xem thêm: Doanh nghiệp bị từ chối xác nhận nghĩa vụ thuế – Nguyên nhân & cách xử lý

VII. CHIẾN LƯỢC XỬ LÝ KHI DOANH NGHIỆP ĐANG THANH TRA NHƯNG CẦN GẤP XÁC NHẬN

Khi có nhu cầu cấp bách, doanh nghiệp nên thực hiện chiến lược 3 bước:

1. Đánh giá phạm vi thanh tra

• Thanh tra toàn diện hay chuyên đề?
• Đã có biên bản làm việc chưa?
• Có dấu hiệu truy thu lớn không?

2. Làm việc trực tiếp với cán bộ quản lý thuế

Doanh nghiệp nên:

• Trình bày nhu cầu cấp bách
• Cung cấp hồ sơ minh bạch
• Đề nghị hướng dẫn cụ thể bằng văn bản

3. Chủ động xử lý rủi ro tiềm ẩn

• Tự rà soát lại toàn bộ nghĩa vụ
• Nộp bổ sung nếu phát hiện sai sót
• Giảm thiểu khả năng phát sinh truy thu sau kết luận

Ảnh 2: Chiến lược xử lý khi đang thanh tra thuế nhưng cần xác nhận nghĩa vụ – Luật TLK 097.211.8764/ 0969.760.195

VIII. TÁC ĐỘNG ĐẾN CÁC THỦ TỤC KHÁC CỦA DOANH NGHIỆP

Thanh tra thuế chưa kết thúc có thể ảnh hưởng trực tiếp đến:

1. Thủ tục giải thể
2. Chuyển nhượng doanh nghiệp
3. Đăng ký thay đổi người đại diện
4. Rút vốn đầu tư
5. Đóng mã số thuế

👉 Xem thêm: Doanh nghiệp đang bị thanh tra thuế có được xác nhận hoàn thành nghĩa vụ thuế không?

Việc không tính toán yếu tố thanh tra từ đầu có thể khiến kế hoạch tái cấu trúc bị trì hoãn nhiều tháng.

IX. CÁC TÌNH HUỐNG THỰC TIỄN DOANH NGHIỆP THƯỜNG GẶP

Trong quá trình tư vấn, các tình huống phổ biến khi doanh nghiệp đang thanh tra nhưng cần xác nhận nghĩa vụ thuế bao gồm:

1. Doanh nghiệp chuẩn bị giải thể nhưng bất ngờ có quyết định thanh tra

Trường hợp này thường dẫn đến:

• Hồ sơ giải thể bị đình lại.
• Phải chờ kết luận thanh tra trước khi được xác nhận nghĩa vụ thuế.

Giải pháp là chủ động làm việc với cơ quan thuế để xác định rõ phạm vi thanh tra và dự kiến thời gian kết thúc.

2. Doanh nghiệp cần xác nhận để tham gia đấu thầu

Nhiều hồ sơ đấu thầu yêu cầu chứng minh đã hoàn thành nghĩa vụ thuế. Nếu đang thanh tra:

• Có thể bị loại do thiếu xác nhận.
• Ảnh hưởng trực tiếp đến cơ hội kinh doanh.

Do đó cần lên kế hoạch dự phòng trước khi nộp hồ sơ dự thầu.

3. Doanh nghiệp chuyển nhượng vốn khi đang thanh tra

Nếu chưa có xác nhận nghĩa vụ thuế:

• Việc chuyển nhượng có thể bị trì hoãn.
• Nhà đầu tư yêu cầu làm rõ rủi ro thuế tiềm ẩn.

👉 Xem thêm: Chưa xác nhận hoàn thành nghĩa vụ thuế có được chuyển nhượng doanh nghiệp không? Phân tích mới nhất

Ảnh 3: Liên hệ ngay Công ty Luật TLK để được tư vấn - Hotline 097.211.8764 / 0969.760.195

X. CÁC CÂU HỎI THƯỜNG GẶP CỦA KHÁCH HÀNG

1. Doanh nghiệp đang thanh tra thuế có được xác nhận hoàn thành nghĩa vụ thuế không?
Trong đa số trường hợp, không. Khi thanh tra chưa kết thúc và chưa có kết luận chính thức, nghĩa vụ thuế chưa được xác định cuối cùng nên cơ quan thuế thường tạm dừng xác nhận.

2. Thanh tra và kiểm tra thuế có ảnh hưởng giống nhau đến việc xác nhận không?
Không hoàn toàn. Thanh tra thường có phạm vi rộng và mức độ rủi ro cao hơn, trong khi kiểm tra chuyên đề có thể không ảnh hưởng toàn diện nếu không phát sinh truy thu lớn.

3. Nếu thanh tra đã lập biên bản nhưng chưa ban hành kết luận thì có được xác nhận không?
Thông thường vẫn chưa. Chỉ khi có kết luận chính thức và doanh nghiệp đã thực hiện đầy đủ nghĩa vụ theo kết luận thì việc xác nhận mới được xem xét.

4. Trường hợp truy thu nhỏ có được xác nhận tạm thời không?
Dù số tiền nhỏ, nếu chưa nộp đầy đủ thì chưa được coi là hoàn thành nghĩa vụ thuế. Việc xác nhận chỉ thực hiện khi không còn nghĩa vụ tồn đọng.

5. Thanh tra kéo dài có làm ảnh hưởng thủ tục giải thể không?
Có. Giải thể doanh nghiệp bắt buộc phải có xác nhận hoàn thành nghĩa vụ thuế, vì vậy thanh tra chưa kết thúc có thể làm đình trệ toàn bộ quá trình.

6. Doanh nghiệp có quyền yêu cầu đẩy nhanh thanh tra không?
Không có quyền yêu cầu bắt buộc, nhưng có thể chủ động phối hợp cung cấp hồ sơ, tài liệu đầy đủ để rút ngắn thời gian xử lý.

7. Việc xin xác nhận khi biết đang thanh tra có bị coi là vi phạm không?
Không phải hành vi vi phạm nếu minh bạch, nhưng có thể bị từ chối và khiến cơ quan thuế đánh giá rủi ro cao hơn.

8. Có thể xác nhận nghĩa vụ thuế từng phần theo từng sắc thuế không?
Thông thường không. Xác nhận hoàn thành nghĩa vụ thuế mang tính tổng thể, bao gồm tất cả các sắc thuế liên quan.

9. Sau khi kết luận thanh tra, bao lâu có thể xin xác nhận?
Ngay khi doanh nghiệp đã nộp đủ tiền truy thu, tiền phạt và tiền chậm nộp (nếu có), có thể nộp hồ sơ đề nghị xác nhận.

10. Làm thế nào để hạn chế rủi ro bị đình trệ khi có kế hoạch tái cấu trúc?
Doanh nghiệp nên chủ động đối chiếu nghĩa vụ thuế định kỳ, hoàn tất quyết toán trước khi phát sinh giao dịch lớn và đánh giá rủi ro thuế trước khi thực hiện các thay đổi quan trọng

👉 Quý Khách hàng có thể tham khảo thêm thông tin về Hệ sinh thái TLK và các gói ưu đãi dịch vụ Pháp lý, Kế toán – Thuế đang được áp dụng dưới đây.

🔗 Chính sách ưu đãi dịch vụ pháp lý của Công ty Luật TLK

🔗 Chính sách ưu đãi dịch vụ Kế toán – Thuế của Công ty Tư vấn và Đại lý thuế TLK Global

🔗 Hệ sinh thái TLK: Công ty Luật TLK và Công ty Tư vấn và Đại lý Thuế TLK Global

XI. KẾT LUẬN

Thanh tra hoặc kiểm tra thuế là giai đoạn mà nghĩa vụ thuế của doanh nghiệp chưa được xác định cuối cùng. Vì vậy, trong phần lớn trường hợp, cơ quan thuế sẽ tạm dừng việc xác nhận hoàn thành nghĩa vụ thuế cho đến khi có kết luận chính thức.

Doanh nghiệp cần:

1. Đánh giá đúng phạm vi thanh tra.
2. Chủ động xử lý các sai lệch tiềm ẩn.
3. Lập kế hoạch thủ tục kinh doanh phù hợp với tiến độ thanh tra.

Sự chuẩn bị chủ động giúp doanh nghiệp tránh rủi ro đình trệ và giảm thiểu hệ quả pháp lý không mong muốn.

XII. THÔNG TIN LIÊN HỆ CÔNG TY LUẬT TLK 

Với năng lực chuyên sâu trong Kế toán – Thuế – Doanh nghiệp – Đầu tư – Giải quyết tranh chấp, Công ty Luật TLK đồng hành cùng doanh nghiệp từ khâu rà soát nghĩa vụ thuế, xử lý hồ sơ bị tạm dừng xác nhận đến đại diện làm việc với cơ quan thuế trong giai đoạn thanh tra.

Chúng tôi không chỉ cung cấp dịch vụ đơn lẻ – mà chúng tôi còn kiến tạo hệ thống bảo vệ doanh nghiệp một cách thực chất và bền vững.

CÔNG TY LUẬT TLK

🌐 Website: https://tlklawfirm.vn
📧 Email: info@tlklawfirm.vn
☎ Tel: 0243.2011.747
📞 Hotline: 097.211.8764 / 0969.760.195