Thủ tục xin hưởng ưu đãi đầu tư: thuế TNDN, thuế nhập khẩu, tiền thuê Công ty Luật TLK

I. CĂN CỨ PHÁP LÝ ÁP DỤNG

Luật Đầu tư số 61/2020/QH14 do Quốc hội thông qua ngày 17/6/2020;
Luật Thuế thu nhập doanh nghiệp số 14/2008/QH12, đã được sửa đổi, bổ sung;
Luật Thuế xuất khẩu, thuế nhập khẩu số 107/2016/QH13 do Quốc hội thông qua ngày 06/4/2016;
Luật Đất đai số 45/2013/QH13 do Quốc hội thông qua ngày 29/11/2013;
Nghị định số 31/2021/NĐ-CP do Chính phủ ban hành ngày 26/3/2021;
Các văn bản hướng dẫn còn hiệu lực của Bộ Tài chính, Bộ Kế hoạch và Đầu tư.

II. NHẬN ĐỊNH PHÁP LÝ VÀ CHIẾN LƯỢC KIỂM SOÁT RỦI RO

Doanh nghiệp và nhà đầu tư chỉ được hưởng ưu đãi đầu tư khi dự án đáp ứng đúng điều kiện pháp luật và thực hiện đúng thủ tục với cơ quan có thẩm quyền; việc “tự áp dụng ưu đãi” khi chưa được xác nhận là rủi ro rất lớn và có thể bị truy thu, xử phạt.

Trên thực tế, nhiều doanh nghiệp triển khai dự án đầu tư nhưng không được hưởng ưu đãi hoặc bị truy thu ưu đãi đã áp dụng, không phải vì dự án không đủ điều kiện, mà do xác định sai loại ưu đãi, sai thời điểm áp dụng hoặc không thực hiện đúng thủ tục xin hưởng ưu đãi ngay từ đầu. Đặc biệt, các ưu đãi liên quan đến thuế thu nhập doanh nghiệp, thuế nhập khẩu và tiền thuê đất đều có cơ chế áp dụng, hồ sơ và cơ quan giải quyết khác nhau, nếu làm gộp hoặc làm thiếu sẽ dẫn đến rủi ro pháp lý nghiêm trọng.

Bài viết này phân tích đầy đủ – cập nhật – đúng luật về thủ tục xin hưởng ưu đãi đầu tư mới nhất hiện nay, giúp Quý doanh nghiệp:

Nhận diện chính xác các loại ưu đãi được hưởng;
Chuẩn bị hồ sơ đúng, đủ ngay từ đầu;
Tránh rủi ro bị từ chối hoặc truy thu ưu đãi.

👉 Xem thêm: Điều kiện đầu tư nước ngoài tại Việt Nam của công ty luật TLK

III. TỔNG QUAN VỀ ƯU ĐÃI ĐẦU TƯ THEO PHÁP LUẬT HIỆN HÀNH

1. Ưu đãi đầu tư là gì?

Ưu đãi đầu tư là chính sách hỗ trợ đặc thù của Nhà nước dành cho nhà đầu tư và doanh nghiệp khi thực hiện dự án thuộc ngành, nghề ưu đãi, địa bàn ưu đãi hoặc đáp ứng các điều kiện khuyến khích đầu tư theo quy định của pháp luật.

Các ưu đãi này không tự động áp dụng, mà phải được xác định, ghi nhận và thực hiện đúng thủ tục với cơ quan có thẩm quyền.

2. Mục tiêu của chính sách ưu đãi đầu tư

Chính sách ưu đãi đầu tư nhằm:

Thu hút vốn đầu tư trong và ngoài nước;
Khuyến khích phát triển ngành nghề ưu tiên;
Thúc đẩy đầu tư vào địa bàn khó khăn, đặc biệt khó khăn;
Nâng cao năng lực cạnh tranh của nền kinh tế.

3. Đối tượng được hưởng ưu đãi đầu tư

Ưu đãi đầu tư được áp dụng cho:

Dự án đầu tư mới;
Dự án đầu tư mở rộng đáp ứng điều kiện;
Doanh nghiệp có hoạt động đầu tư thuộc diện ưu đãi theo quy định pháp luật.

Ảnh 1: Ưu đãi đầu tư tại Việt Nam – Công ty Luật TLK – Hotline 097.211.8764

IV. CÁC NHÓM ƯU ĐÃI ĐẦU TƯ ĐANG ÁP DỤNG HIỆN NAY

Theo quy định pháp luật hiện hành, ưu đãi đầu tư được chia thành 03 nhóm chính, mỗi nhóm có điều kiện và thủ tục áp dụng riêng.

1. Ưu đãi thuế thu nhập doanh nghiệp

Ưu đãi thuế thu nhập doanh nghiệp bao gồm:

Áp dụng thuế suất ưu đãi trong thời hạn nhất định;
Miễn thuế, giảm thuế trong một số năm đầu hoạt động.

Ưu đãi này chỉ được áp dụng khi doanh nghiệp đáp ứng đủ điều kiện và thực hiện kê khai, quyết toán đúng quy định.

2. Ưu đãi thuế nhập khẩu

Ưu đãi thuế nhập khẩu áp dụng đối với:

Máy móc, thiết bị, phương tiện vận tải chuyên dùng;
Nguyên liệu, vật tư nhập khẩu phục vụ trực tiếp cho dự án đầu tư.

Danh mục hàng hóa được miễn thuế phải được đăng ký và xác nhận trước khi làm thủ tục hải quan.

3. Ưu đãi về tiền thuê đất, thuê mặt nước

Ưu đãi về tiền thuê đất bao gồm:

Miễn tiền thuê đất trong thời gian nhất định;
Giảm tiền thuê đất theo tỷ lệ hoặc thời hạn.

Ưu đãi này không áp dụng tự động, mà phải được cơ quan nhà nước có thẩm quyền chấp thuận bằng văn bản.

👉 Xem thêm: Ưu đãi thuế thu nhập doanh nghiệp cho dự án đầu tư.

👉 Xem thêm: Dịch vụ tư vấn pháp lý thường xuyên cho doanh nghiệp có vốn đầu tư nước ngoài

V. ĐIỀU KIỆN ĐỂ ĐƯỢC HƯỞNG ƯU ĐÃI ĐẦU TƯ

Việc được hưởng ưu đãi đầu tư không phát sinh tự động mà chỉ được áp dụng khi dự án/ doanh nghiệp đồng thời đáp ứng đủ điều kiện pháp lý và thực hiện đúng thủ tục theo từng loại ưu đãi.

1. Điều kiện về ngành, nghề ưu đãi đầu tư

Dự án phải thuộc ngành, nghề được ưu đãi đầu tư theo quy định pháp luật, tiêu biểu như:

Công nghệ cao, công nghiệp hỗ trợ, nghiên cứu – phát triển;
Sản xuất sản phẩm phần mềm, nội dung số;
Giáo dục – đào tạo, y tế, môi trường;
Nông nghiệp ứng dụng công nghệ cao.

Trường hợp dự án không thuộc ngành nghề ưu đãi, doanh nghiệp không được hưởng các ưu đãi tương ứng, dù đã đi vào hoạt động.

2. Điều kiện về địa bàn ưu đãi đầu tư

Dự án đầu tư tại:

Địa bàn có điều kiện kinh tế – xã hội khó khăn;
Địa bàn có điều kiện kinh tế – xã hội đặc biệt khó khăn;
Khu công nghiệp, khu kinh tế, khu công nghệ cao,

có thể được hưởng mức ưu đãi cao hơn so với địa bàn thông thường, đặc biệt đối với thuế thu nhập doanh nghiệp và tiền thuê đất.

3. Điều kiện về quy mô, vốn, lao động và công nghệ

Tùy từng loại ưu đãi, dự án phải đáp ứng một hoặc nhiều điều kiện sau:

Mức vốn đầu tư tối thiểu;
Quy mô sử dụng lao động;
Cam kết chuyển giao công nghệ, đổi mới công nghệ;
Đáp ứng tiêu chí doanh nghiệp công nghệ cao, doanh nghiệp khoa học và công nghệ.

4. Điều kiện về thời điểm áp dụng ưu đãi

Đây là điểm doanh nghiệp rất hay nhầm lẫn:

Ưu đãi thuế thu nhập doanh nghiệp chỉ được áp dụng khi phát sinh thu nhập chịu thuế;
Ưu đãi thuế nhập khẩu chỉ áp dụng cho danh mục đã đăng ký, trước thời điểm nhập khẩu;
Ưu đãi tiền thuê đất chỉ áp dụng sau khi có quyết định chấp thuận của cơ quan nhà nước.

Nếu áp dụng sai thời điểm, doanh nghiệp có nguy cơ bị truy thu toàn bộ ưu đãi đã hưởng.

VI. HỒ SƠ XIN HƯỞNG ƯU ĐÃI ĐẦU TƯ (CHI TIẾT THEO TỪNG LOẠI)

1. Hồ sơ xin hưởng ưu đãi thuế thu nhập doanh nghiệp

Hồ sơ cơ bản gồm:

Văn bản đề nghị áp dụng ưu đãi thuế thu nhập doanh nghiệp;
Bản sao Giấy chứng nhận đăng ký đầu tư hoặc Quyết định chấp thuận chủ trương đầu tư;
Tài liệu chứng minh dự án thuộc ngành, nghề hoặc địa bàn ưu đãi;
Báo cáo tình hình triển khai dự án;
Hồ sơ kế toán – tài chính liên quan đến việc xác định thu nhập chịu thuế.

2. Hồ sơ xin hưởng ưu đãi thuế nhập khẩu

Hồ sơ thường bao gồm:

Văn bản đề nghị miễn thuế nhập khẩu;
Danh mục máy móc, thiết bị, phương tiện, nguyên liệu nhập khẩu;
Tài liệu chứng minh hàng hóa phục vụ trực tiếp cho dự án đầu tư;
Giấy chứng nhận đăng ký đầu tư;
Các tài liệu theo yêu cầu của cơ quan hải quan.

Danh mục hàng hóa phải được đăng ký và xác nhận trước khi làm thủ tục nhập khẩu.

3. Hồ sơ xin hưởng ưu đãi tiền thuê đất

Hồ sơ gồm:

Văn bản đề nghị miễn, giảm tiền thuê đất;
Quyết định cho thuê đất hoặc hợp đồng thuê đất;
Giấy chứng nhận đăng ký đầu tư/Quyết định chủ trương đầu tư;
Tài liệu chứng minh dự án thuộc diện ưu đãi;
Hồ sơ tài chính liên quan đến nghĩa vụ đất đai.

Ảnh 2: Hồ sơ xin hưởng ưu đãi đầu tư – Công ty Luật TLK – Hotline 097.211.8764

VII. TRÌNH TỰ – THỦ TỤC XIN HƯỞNG ƯU ĐÃI ĐẦU TƯ

1. Rà soát điều kiện và xác định loại ưu đãi

Doanh nghiệp cần:

Đối chiếu ngành nghề, địa bàn, quy mô dự án;
Xác định chính xác loại ưu đãi được hưởng;
Đánh giá rủi ro pháp lý nếu áp dụng sai.

2. Chuẩn bị hồ sơ theo từng nhóm ưu đãi

Hồ sơ phải:

Đầy đủ, thống nhất giữa các tài liệu;
Có dẫn chiếu rõ căn cứ pháp lý;
Phù hợp với tình trạng thực tế của dự án.

3. Nộp hồ sơ tại cơ quan có thẩm quyền

Tùy loại ưu đãi, hồ sơ được nộp tại:

Cơ quan đăng ký đầu tư;
Cơ quan thuế;
Cơ quan hải quan;
Cơ quan quản lý đất đai.

4. Thẩm tra và chấp thuận áp dụng ưu đãi

Cơ quan nhà nước sẽ:

Kiểm tra điều kiện hưởng ưu đãi;
Yêu cầu bổ sung, giải trình (nếu cần);
Ban hành văn bản chấp thuận hoặc thông báo áp dụng ưu đãi.

5. Áp dụng ưu đãi và theo dõi tuân thủ

Sau khi được chấp thuận:

Doanh nghiệp được áp dụng ưu đãi theo quy định;
Phải lưu trữ hồ sơ, chứng từ;
Thực hiện báo cáo, kê khai đúng thời hạn.

👉 Xem thêm: Thủ tục đăng ký điều chỉnh dự án đầu tư FDI tại Việt Nam

VIII. HỒ SƠ BỊ TỪ CHỐI VÀ CÁCH CÔNG TY LUẬT TLK XỬ LÝ

1. Các lý do hồ sơ xin ưu đãi đầu tư thường bị từ chối

Thực tiễn cho thấy hồ sơ xin hưởng ưu đãi đầu tư thường bị từ chối do các nguyên nhân sau:

Xác định sai ngành, nghề hoặc địa bàn ưu đãi, dẫn đến áp dụng ưu đãi không có căn cứ;
Áp dụng sai thời điểm ưu đãi, đặc biệt với thuế thu nhập doanh nghiệp và thuế nhập khẩu;
Hồ sơ thiếu căn cứ pháp lý, thiếu tài liệu chứng minh mối liên hệ giữa ưu đãi và dự án;
Danh mục hàng hóa miễn thuế nhập khẩu chưa được đăng ký trước khi làm thủ tục hải quan;
Chưa có quyết định miễn, giảm tiền thuê đất nhưng đã tự áp dụng ưu đãi;
Hồ sơ kế toán, báo cáo tài chính không đồng nhất với hồ sơ đầu tư.

2. Cách Công ty Luật TLK xử lý hồ sơ bị vướng, bị từ chối

Trong các trường hợp hồ sơ bị từ chối hoặc có nguy cơ bị truy thu ưu đãi, Công ty Luật TLK thường triển khai đồng thời:

Rà soát lại toàn bộ điều kiện ưu đãi theo pháp luật hiện hành;
Điều chỉnh cách áp dụng ưu đãi cho đúng loại, đúng thời điểm;
Bổ sung giải trình pháp lý chuyên sâu kèm dẫn chiếu quy định còn hiệu lực;
Làm việc trực tiếp với cơ quan thuế, cơ quan hải quan, cơ quan đăng ký đầu tư để tháo gỡ vướng mắc;
Tư vấn phương án khắc phục hậu quả, giảm thiểu rủi ro truy thu và xử phạt.

Đây là mục mang tính Experience thực tiễn và là đòn chuyển đổi mạnh của Công ty Luật TLK.

Ảnh 3: Quy trình xin hưởng ưu đãi đầu tư – Công ty Luật TLK – Hotline 097.211.8764

IX. LỢI ÍCH KHI THỰC HIỆN ĐÚNG THỦ TỤC XIN HƯỞNG ƯU ĐÃI ĐẦU TƯ

Việc thực hiện đúng thủ tục ngay từ đầu mang lại các lợi ích rõ rệt:

Đảm bảo quyền hưởng ưu đãi hợp pháp, tránh rủi ro bị truy thu;
Tối ưu chi phí đầu tư và vận hành cho doanh nghiệp;
Hạn chế tranh chấp, khiếu nại với cơ quan quản lý nhà nước;
Tạo nền tảng pháp lý vững chắc cho việc mở rộng dự án, kiểm toán, gọi vốn sau này.

X. QUY TRÌNH CÔNG TY LUẬT TLK HỖ TRỢ XIN ƯU ĐÃI ĐẦU TƯ

Công ty Luật TLK triển khai quy trình hỗ trợ trọn gói – kiểm soát rủi ro – đúng pháp luật, gồm:

Rà soát dự án, ngành nghề, địa bàn và khả năng hưởng ưu đãi;
Tư vấn chiến lược áp dụng ưu đãi phù hợp với từng giai đoạn dự án;
Soạn thảo hồ sơ xin hưởng ưu đãi theo từng loại (thuế TNDN, thuế nhập khẩu, tiền thuê đất);
Đại diện làm việc với cơ quan nhà nước có thẩm quyền;
Hỗ trợ doanh nghiệp trong quá trình kê khai, áp dụng và hậu kiểm ưu đãi.

👉 Xem thêm: Dịch vụ tư vấn ưu đãi đầu tư cho doanh nghiệp và dự án FDI

👉 Xem thêm: Dịch vụ kế toán thuế cho doanh nghiệp FDI của TLK global

XI. CAM KẾT DỊCH VỤ CỦA CÔNG TY LUẬT TLK

Công ty Luật TLK cam kết:

Tư vấn đúng quy định – đúng bản chất ưu đãi;
Hồ sơ đầy đủ, logic, có căn cứ pháp lý rõ ràng;
Kiểm soát rủi ro truy thu, xử phạt ở mức thấp nhất;
Bảo mật tuyệt đối thông tin dự án và doanh nghiệp;
Đồng hành lâu dài trong suốt quá trình triển khai và vận hành dự án.

XII. CÁC CÂU HỎI THƯỜNG GẶP CỦA DOANH NGHIỆP

1. Ưu đãi đầu tư có được áp dụng tự động không?–
→ Không. Doanh nghiệp chỉ được hưởng ưu đãi khi đáp ứng điều kiện và thực hiện đúng thủ tục theo quy định.

2. Có thể xin hưởng đồng thời nhiều loại ưu đãi đầu tư không?
→ Có, nếu đáp ứng đủ điều kiện của từng loại ưu đãi.

3. Ưu đãi thuế thu nhập doanh nghiệp được áp dụng từ thời điểm nào?
→ Từ năm đầu tiên phát sinh thu nhập chịu thuế, không phải từ năm cấp phép đầu tư.

4. Thuế nhập khẩu được miễn cho tất cả hàng hóa nhập khẩu không?
→ Không. Chỉ áp dụng cho danh mục hàng hóa phục vụ trực tiếp cho dự án và đã đăng ký trước.

5. Tiền thuê đất có được miễn toàn bộ trong suốt thời gian thuê không?
→ Không. Chỉ được miễn, giảm trong thời hạn nhất định theo quyết định chấp thuận.

6. Doanh nghiệp trong khu công nghiệp có đương nhiên được ưu đãi không?
→ Không phải mọi trường hợp. Cần đối chiếu cụ thể ngành nghề và điều kiện áp dụng.

7. Hồ sơ xin ưu đãi đầu tư nộp ở đâu?
→ Tùy loại ưu đãi, nộp tại cơ quan đăng ký đầu tư, cơ quan thuế, hải quan hoặc cơ quan quản lý đất đai.

8. Nếu đã áp dụng sai ưu đãi thì xử lý thế nào?
→ Cần rà soát và điều chỉnh kịp thời, tránh bị truy thu và xử phạt.

9. Có bắt buộc phải thuê đơn vị tư vấn không?
→ Không bắt buộc, nhưng giúp hạn chế rủi ro pháp lý và tiết kiệm thời gian.

10. Khi nào nên xin tư vấn ưu đãi đầu tư?
→ Ngay từ giai đoạn chuẩn bị dự án hoặc trước khi bắt đầu áp dụng ưu đãi.

👉 Quý Khách hàng có thể tham khảo thêm thông tin về Hệ sinh thái TLK và các gói ưu đãi dịch vụ Pháp lý, Kế toán – Thuế đang được áp dụng dưới đây.

🔗 Chính sách ưu đãi dịch vụ pháp lý của Công ty Luật TLK

🔗 Chính sách ưu đãi dịch vụ Kế toán – Thuế của Công ty Tư vấn và Đại lý thuế TLK Global

🔗 Hệ sinh thái TLK: Công ty Luật TLK và Công ty Tư vấn và Đại lý Thuế TLK Global